经过了两年的共同生活，如今斯图亚特（迈克尔·J·福克斯配音）和乔治一家过得融洽和睦，斯图亚特还是一如既往的聪明精灵，然而内心却为了一件事有点不安——乔治母亲添了小女儿，他们对这个千金宠爱有加，几乎花掉全部时间精力而乔治（乔纳森·利普尼基饰）功课也日渐繁忙，陪伴斯图亚特的时间也少了。斯图亚特有点落寞，直到它遇上了鸽子玛格罗（梅兰尼·格里菲斯配音）。 斯图亚特上演了一幕英雄救美，把玛格罗从危难中解救出来，并带她回家疗伤，心里对她暗暗倾慕。然而斯图亚特的恋爱并不是特别顺利，他不知道玛格罗有着不为人知的秘密，这只机智勇敢的小白鼠面临着又一次充满挑战的冒险。
